Le CCVS s’est donné pour mission de préserver la richesse et la diversité du patrimoine végétal, en fédérant les collectionneurs de plantes sauvages et cultivées, et tous ceux qui les soutiennent. Les collectionneurs peuvent être publics ou privés, pépiniéristes, horticulteurs, services d’espaces verts, jardins botaniques, ou collectionneurs amateurs.

La tâche principale de l’association est de recenser, puis d’évaluer les grandes collections végétales à vocation botanique ou horticole. Si elles satisfont à des critères scientifiques définis par un comité d’experts, elles reçoivent alors le label de « Collection agréée CCVS » ou de « Collection nationale CCVS ». 

Le CCVS a établi une charte des collections. Ce document fixe des critères généraux pour l’ensemble des collections, comme l’origine responsable des végétaux, la nécessité de multiplier les plantes dans d’autres lieux, ou les principes de suivi et d’étiquetage. Grâce à cette charte, les collectionneurs adhérents s’intègrent et s’engagent dans une véritable démarche scientifique et participative.